FS? Mix Direct for Tissue
Cat. #:P2071b,P2072b
產品簡介
FS??Mix Direct for Tissue是適合組(zu)織樣(yang)(yang)本(ben)(ben)擴增(zeng)(zeng)的(de)(de)2×濃(nong)縮(suo)快速高效PCR預混合溶液(ye),含有FS? Taq DNA聚合酶、dNTP混合物(wu)、緩沖液(ye)等PCR擴增(zeng)(zeng)必需(xu)組(zu)分(fen)(模板(ban)與(yu)引物(wu)除外)。使(shi)用(yong)(yong)時(shi)(shi),僅(jin)需(xu)在擴增(zeng)(zeng)體系中加(jia)入簡單處理(li)(li)后的(de)(de)樣(yang)(yang)本(ben)(ben)處理(li)(li)液(ye)和引物(wu)即可(ke)進行PCR,從(cong)而可(ke)以極(ji)大(da)地簡化操作過(guo)程,縮(suo)短操作時(shi)(shi)間,降低污染(加(jia)樣(yang)(yang)次(ci)數減少(shao)(shao))。FS??Mix Direct for Tissue的(de)(de)反應體系經過(guo)優化處理(li)(li),高靈敏度的(de)(de)FS??Taq DNA聚合酶確保處理(li)(li)液(ye)中的(de)(de)微量樣(yang)(yang)本(ben)(ben)得到(dao)高效擴增(zeng)(zeng)。本(ben)(ben)產品不用(yong)(yong)進行繁瑣的(de)(de)DNA提取,最大(da)限度減少(shao)(shao)實驗誤差和交叉污染;同時(shi)(shi)依靠(kao)特殊的(de)(de)緩沖體系增(zeng)(zeng)強PCR擴增(zeng)(zeng)的(de)(de)特異(yi)性,保證(zheng)擴增(zeng)(zeng)效果(guo)(guo)與(yu)DNA模板(ban)擴增(zeng)(zeng)效果(guo)(guo)同樣(yang)(yang)可(ke)靠(kao)。
FS??Taq DNA聚合酶是根據蛋白工程原理,以Taq DNA聚合酶為基礎,研發設計的新一代DNA聚合酶。本產品具有類似KOD酶的快速擴增能力,延伸速度為20s/kb(70~75℃,簡單模板可達5s/kb)。是普通Taq DNA聚合酶的3倍,可縮短一半以上的擴增時間;同時具備Taq DNA聚合酶擴增效率高、適應性廣等優點。FS??Taq DNA聚合酶使用方法與普通Taq DNA聚合酶基本相同,只需注意適當縮短延伸時間。該酶具有5'→3'聚合酶活性,無3'→5'外切酶活性。擴增產物具有3'-dA突出端,可直接用于TA克隆。
產品組成
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Component |
P2071b |
P2072b |
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2× FS??Mix ? Direct for Tissue |
1 ml |
1 ml× 5 |
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超純水 |
1 ml |
1 ml× 5 |
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Neutralization? ? Solution?? |
1 ml |
5 ml |
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Extraction? ? Solution???? |
10 ? ml |
40 ? ml |
本產(chan)品(pin)分體(ti)系中包(bao)含(han)溴(xiu)酚藍、不含(han)溴(xiu)酚藍兩類。體(ti)系中包(bao)含(han)溴(xiu)酚藍的(de)產(chan)品(pin),PCR擴增(zeng)產(chan)物可直接電泳檢測。這兩類產(chan)品(pin)的(de)擴增(zeng)性能無差異。如無特別(bie)說明(ming)提供體(ti)系中包(bao)含(han)溴(xiu)酚藍的(de)包(bao)裝。
保存條件
-20℃保存2年。
質量控制
純(chun)度檢(jian)測:經質量檢(jian)測,產(chan)品不(bu)含(han)脫氧核(he)糖(tang)(tang)核(he)酸(suan)(suan)內(nei)切酶(mei)、脫氧核(he)糖(tang)(tang)核(he)酸(suan)(suan)外切酶(mei)和核(he)糖(tang)(tang)核(he)酸(suan)(suan)酶(mei)污染。
功(gong)能檢測:PCR方法檢測無(wu)宿主殘余DNA,能有(you)效(xiao)擴增(zeng)人基因組中的(de)單拷(kao)貝基因。
應用舉例
1.?處理樣品
組織:取3-5mg組織置于1.5ml離心管中,加(jia)(jia)入180 μl Extraction?Solution,充分渦(wo)旋(xuan)振蕩,95℃溫浴10min。加(jia)(jia)入20 μl?Neutralization?Solution,充分渦(wo)旋(xuan)振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進行擴增。
頭發:取兩根(gen)帶毛(mao)囊的頭發(fa),剪下(xia)帶毛(mao)囊的發(fa)根(gen)放(fang)入1.5ml離心(xin)管中,加(jia)入180 μl Extraction?Solution,充分(fen)渦旋振(zhen)蕩,95℃溫浴10min。加(jia)入20 μl?Neutralization?Solution,充分(fen)渦旋振(zhen)蕩,5000rpm離心(xin)2min,取0.5-2 μl上清進行擴增。
口腔拭子:取樣前30min內(nei)請勿進(jin)食及(ji)飲水,使用無菌棉簽在口(kou)腔內(nei)擦拭10次。將棉球(qiu)剪(jian)下置于1.5ml離心管中,加(jia)入180 μl Extraction? Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加(jia)入20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上(shang)清進(jin)行(xing)擴(kuo)增。
培養細胞:如果是懸浮培養細胞直接取1×103-104當量的細胞加(jia)入(ru)到(dao)50 μl?PCR反(fan)應體系中即可。如果是(shi)貼壁培養細胞,取3-5mg細胞組織置于(yu)1.5ml離心管中,加(jia)入(ru)180 μl Extraction?Solution,充分渦旋(xuan)振蕩,95℃溫浴10min。加(jia)入(ru)20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋(xuan)振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jin)行擴增。
血液、淋巴液DNA病毒:取100 μl血清(qing)(qing)或淋巴液(ye)至1.5ml離心管中,加(jia)入(ru)180 μl Extraction?Solution,充(chong)(chong)分渦(wo)旋振(zhen)蕩,95℃溫(wen)浴10min。加(jia)入(ru)20 μl?Neutralization? Solution,充(chong)(chong)分渦(wo)旋振(zhen)蕩,12,000rpm離心10min,取0.5-2 μl上清(qing)(qing)進行擴增。
2.?配制反應體系
請于冰上配置反應體系,體系大小與組分用量與添加順序可調整:
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Ordinal |
Component |
Volume (50 μl reaction volume) |
Final ? concentration (50 μl reaction volume) |
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1 |
2× FS??Mix ? Direct for Tissue |
25 ? μl |
1× |
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2 |
upstream ? primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 ? μM |
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3 |
downstream ? primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 ? μM |
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4 |
處理液上清 |
0.5-2 ? μl |
<1μg |
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5 |
超純水[2] |
To 50 ? μl |
- |
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optional |
MgCl2(MgSO4)/PCR ? Enhancer[3] |
Variable |
- |
[1]?引物終濃(nong)度建議范圍:0.1-1 μM。特異(yi)性差時可降低濃(nong)度,效率低時可提高濃(nong)度。
[2]?可單獨訂購超(chao)純(chun)水(Cat. #:P9021/P9022/P9023)。
[3]?可單獨訂購25mM MgCl2(Cat. #:P9031)和PCR Enhancer(Cat. #:P9041)。
3.?設定反應程序進行PCR反應
大多數模板(ban)的快速(su)擴增條件:
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Stage ? |
Temperature |
Time |
Number ? of Cycles |
|
Initial ? Denaturation |
94℃ |
3 ? min |
1 |
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Denaturation |
94℃ |
30 ? sec |
28-40 ? |
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Annealing |
55-68℃[1] |
30 ? sec |
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Extension |
72℃ |
Variable[2] |
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Final ? Extension |
72℃ |
2 ? min |
1 |
[1]?退火溫度應根據Tm值(zhi)較低的(de)引物來設。
[2]?延伸時間按20 sec/kb來設最佳。
1kb簡單模板的快速擴增條件:
由(you)于(yu)1kb簡(jian)單模板的二(er)級結(jie)構簡(jian)單,且長度較短(duan),可同時(shi)(shi)縮(suo)短(duan)變(bian)性、退火時(shi)(shi)間(jian)至15s,延伸時(shi)(shi)間(jian)20s,以(yi)實現(xian)快速擴增。
4.?分析結果
反應產物可直接進行瓊脂糖凝膠電泳,通過凝膠成像設備觀察目的條帶的擴增情況。如有需要,可進行割膠回收。無產物或產物量少的改進措施有:1調整退火溫度;2減少抑制劑的影響,如提取的基因組DNA中含有抑制擴增的成分,需要高倍稀釋(1: 10000)后使用;3采用乙醇沉降洗脫,提高模板DNA的純度;4使用PCR添加劑,如PCR Enhancer(Cat. #:P9041)、MgCl2(Cat. #:P9031)等可提高產量。
操作注意事項
處理(li)(li)的(de)組織(zhi)樣本往往不(bu)會(hui)完全溶(rong)解,這是正常(chang)現象。溶(rong)解在處理(li)(li)液中(zhong)的(de)組織(zhi)樣本足夠滿(man)足FS??Mix Direct for Tissue擴增的(de)需要。
室(shi)溫(wen)下FS??Taq DNA聚合酶有一定(ding)的活性,為避免發生(sheng)非(fei)特異(yi)性擴增,請(qing)于冰(bing)上配置反(fan)應體系,并且最后添加模板DNA。
延(yan)伸(shen)時間視片段(duan)(duan)長度而定。一般情(qing)況,≤500bp目的片段(duan)(duan)延(yan)伸(shen)15s,500bp-1kb延(yan)伸(shen)20s,>1kb延(yan)伸(shen)時間按20s/kb計算(suan)。
FS? Taq DNA聚(ju)合酶具有脫(tuo)氧核(he)苷酸轉移酶活性,因此在PCR產物3’末端通常會加上一個多余的(de)脫(tuo)氧腺嘌(piao)呤(ling)核(he)苷,可進(jin)行TA克隆。
FS??Mix Direct for Tissue也可采用常(chang)規程序擴增。
引物設計注意事項
引(yin)(yin)物(wu)長(chang)度一般在15-30個(ge)堿基之(zhi)間;上下(xia)游引(yin)(yin)物(wu)3’末端避(bi)(bi)免互(hu)補,避(bi)(bi)免出(chu)現3個(ge)以上重復的G或(huo)C,或(huo)出(chu)現發(fa)夾結(jie)構,否則會產生非特異性(xing)擴增;GC含量(liang)控制(zhi)在40-60%,且上下(xia)游引(yin)(yin)物(wu)GC含量(liang)盡量(liang)接(jie)近;Tm值(zhi)控制(zhi)在55-65℃之(zhi)間,且上下(xia)游引(yin)(yin)物(wu)Tm值(zhi)盡量(liang)接(jie)近,額外附(fu)加序列(lie)(酶切位點、修飾等)是非模(mo)板匹配序列(lie),不參與Tm值(zhi)計算。
相關產品
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名稱 |
貨號 |
規格 |
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PCR Mix |
P2011/P2012/P2013/P2014/P2015 |
1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
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Power Green qPCR Mix |
P2101/P2102/P2103/P2104/P2105 |
1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
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1kb ladder |
M1181/M1182 |
50次/250次 |
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DSTM5000 |
M1111/M1112 |
60次/300次 |
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高純度質粒小提試劑盒 |
N1011/N1012/N1013 |
50次(ci)/100次(ci)/200次(ci) |
|
通用RNA提取試劑盒(he) |
R1051 |
50次 |
|
基因組DNA快速提取試(shi)劑(ji)盒 |
N1111/N1112 |
50次/100次 |
|
DNA凝(ning)膠(jiao)回收試劑盒(he) |
N1071/N1072/N1073 |
50次/100次/200次 |
|
RT-PCR Kit |
R1011/R1012 |
20次/100次 |
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