在分子生物學(xue)的(de)世界里(li),有一項看(kan)似微(wei)小(xiao)卻至關(guan)重要的(de)技術——當科學(xue)家將DNA樣本注入瓊(qiong)脂糖凝膠的(de)孔槽,接通(tong)電源,原本無(wu)色的(de)核(he)酸(suan)便(bian)在電場作用(yong)下開(kai)始“賽跑(pao)”。而(er)讓這場微(wei)觀(guan)競賽變得肉眼可見(jian)的(de)“魔法藥劑”,正是我(wo)們今天要講述的(de)主角:核(he)酸(suan)電泳染料(liao)。
從(cong)實驗(yan)室到(dao)(dao)診斷(duan)室,從(cong)犯罪現場到(dao)(dao)疫情追蹤,這些神奇的染(ran)色劑讓不(bu)可(ke)見(jian)的生命密碼顯露(lu)出真容。它們的進化史,是(shi)一部關于安(an)全、精準與創新的科學史詩。
第一章:溴化乙(yi)錠時代-功勛(xun)染料的雙面性

20世紀中葉(xie),分子生(sheng)物(wu)學迎來爆發式發展。在(zai)(zai)科(ke)學家迫切需要在(zai)(zai)凝(ning)膠中可視化(hua)DNA的(de)背景下,溴化(hua)乙錠(Ethidium bromide, EB)登上了歷史舞(wu)臺。這種(zhong)橙(cheng)(cheng)紅色粉末(mo)溶于水后,能插入(ru)DNA雙螺旋的(de)堿基對(dui)之(zhi)間,在(zai)(zai)紫外(wai)燈照(zhao)射(she)下發出(chu)明(ming)亮的(de)橙(cheng)(cheng)紅色熒光,即使少至10-20納克的(de)DNA也(ye)無(wu)處遁形。

EB的(de)化學結構及結合DNA機制圖示
EB因(yin)(yin)其(qi)高靈敏度(du)、低成本和(he)操作簡(jian)便迅(xun)速風靡全球實驗室。它幾乎成為(wei)核酸電泳(yong)的代名詞,支撐了包括人類基因(yin)(yin)組計劃在(zai)內的無數重(zhong)大研究。然而隨著時間推移,這種功勛染(ran)料逐漸暴露(lu)出令人不安的另一面:
科(ke)學研(yan)究證實EB具有(you)強誘變性(xing)和(he)潛在致癌風險。它能穿透(tou)皮膚和(he)細胞膜(mo),干擾(rao)DNA復制——這一特性(xing)使(shi)其(qi)成為完美的(de)染色劑,卻也成了實驗人(ren)員的(de)健康噩(e)夢(meng)。實驗后(hou)的(de)凝(ning)膠(jiao)處理(li)更是(shi)棘手難(nan)題,需經過復雜的(de)凈化流程(cheng)才(cai)能避免環境污(wu)染。
第二章:安全變(bian)革-綠色染料的崛(jue)起
21世紀初(chu),環保與(yu)實(shi)驗室(shi)安全(quan)理(li)念興起,推動核(he)酸染料進入“綠色(se)革(ge)命”。科學家們開(kai)始尋(xun)找既能(neng)(neng)保持EB的高靈敏(min)度,又能(neng)(neng)大幅降低毒性的替代品。

SYBR Green I 染色凝膠電(dian)泳圖
SYBR Green系列率(lv)先突圍。這種染(ran)料(liao)源于海(hai)洋珊(shan)瑚蟲熒光蛋(dan)白(bai)的研究靈感,與(yu)DNA結合(he)后信號強(qiang)度可達EB的5-10倍,且誘變性顯著降(jiang)低(di)。但缺點也顯而易見——光穩定性差,需避光操作;改(gai)變 DNA 電(dian)泳遷(qian)移率(lv),使得 DNA 條帶出現彌(mi)散或位移現象,降(jiang)低(di)了電(dian)泳結果的準確性。目前SYBR Green染(ran)料(liao)更多應用于熒光定量PCR實(shi)(shi)驗(yan)中,核(he)酸(suan)電(dian)泳實(shi)(shi)驗(yan)中較少使用。
隨后更多創新產品涌現:
GoldView:中(zhong)國自主研發的低毒染(ran)料。

GoldView與(yu)EB靈敏度對比
GoldView是一種改(gai)進(jin)版的(de)核酸(suan)電泳(yong)染料(liao),通常被認為(wei)是EB的(de)替代品。GoldView在(zai)紫外光(guang)照(zhao)射下同樣(yang)可以與DNA結合并顯示出熒光(guang),具有較高的(de)靈敏度,能夠檢測到(dao)微(wei)量DNA。此外,它(ta)的(de)穩定性(xing)也非(fei)常好(hao),適(shi)用于各種實驗條(tiao)件(jian),同時價(jia)格低廉(lian),因此在(zai)很多(duo)實驗室中,GoldView逐漸替代了EB成為(wei)主流的(de)核酸(suan)染料(liao)。
但GoldView的(de)安全性問題一直存在爭議,同時存在背(bei)景信號(hao)高等問題。
GelRed/GelGreen:大分子安全(quan)染料。

GelRed和GelGreen染色的DNA電泳(yong)圖
GelRed/GelGreen分子結構較大(da),難以(yi)穿(chuan)透(tou)細胞(bao)膜,被列為“非誘(you)變性(xing)(xing)染(ran)料”,具有(you)低毒性(xing)(xing)/無毒性(xing)(xing)的(de)優點,更加安全、環(huan)保,特別適用于需要高度環(huan)保的實驗室(shi)環(huan)境。在紫外光(guang)下與DNA結合時,染料分(fen)子會產生強烈(lie)的熒光(guang),比(bi)EB靈敏度更(geng)高,方(fang)便實驗者進(jin)行電(dian)泳(yong)分(fen)析,也是目前廣泛使用的一類核酸染料。

GelRed 和 GelGreen 不容易穿透細胞
GelRed/GelGreen優勢明顯,但價格較高;此外由于分子量大,對DNA遷(qian)移的影響更(geng)大,容(rong)易出現DNA條帶變(bian)形、難以分(fen)離等問題。
第三章:創新突破-從紫外到藍光
以往的核酸染料(liao)通(tong)常需要(yao)紫(zi)外光(guang)(guang)源(yuan)來激(ji)發染料(liao)與DNA結合(he)后的熒光(guang)(guang),紫(zi)外光(guang)(guang)是(shi)一種(zhong)高能(neng)輻射,會(hui)對實驗人員的皮膚和眼睛(jing)造成傷害(hai),長期接觸(chu)可能(neng)導(dao)致皮膚癌等健康問(wen)題。
藍(lan)光(guang)激(ji)發核酸染料(liao)的(de)出(chu)現為解(jie)決紫外光(guang)染料(liao)的(de)安全性問(wen)題提供了(le)新的(de)解(jie)決方案。與紫外光(guang)源相比,藍(lan)光(guang)的(de)波長較長,對(dui)實(shi)驗者的(de)傷害小,因此成為了(le)現代實(shi)驗室(shi)中(zhong)一種(zhong)更(geng)為安全的(de)激(ji)發光(guang)源。

藍光下的DNA條帶
藍光(guang)(guang)激發(fa)染料通常在450-490nm的(de)(de)波長范(fan)圍內(nei)激發(fa)熒光(guang)(guang),這使(shi)得(de)它們在使(shi)用時既能避免紫外光(guang)(guang)的(de)(de)危害,又能提供足夠的(de)(de)靈敏度來(lai)檢測DNA、RNA等核(he)酸樣本。隨著(zhu)對安全性的(de)(de)重視,越來(lai)越多的(de)(de)實驗室(shi)開始采(cai)用藍光(guang)(guang)激發(fa)電泳(yong)染料。
東盛AIE-Gelgreen即是一種適合藍光激發的核酸染料,而且具有AIE(Aggregation-Induced Emission,聚焦誘導發光)特性,只在有鏈結構的位置才會結合而形成聚集體或被限制運動,從而體現出更大的“從無到有”熒光開關比,實現5分鐘快(kuai)速結合及痕(hen)量物質(zhi)檢測,是一種創新性極高的高靈敏度核酸染料。

東盛DSView與AIE-Gelgreen核酸染料信息
AIE-Gelgreen具有非常高的信噪比,背景干凈,DNA條帶清晰。且分子量適中,對DNA遷移的影響較小,適合預染凝膠使用。兼容藍光和紫外光激發,適用于瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳中的dsDNA,ssDNA和RNA染色,是一種理想的核酸染料。
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回顧核酸染料的發展史,從高危的EB到更加安全、靈敏的藍光染料AIE-Gelgreen,不僅是一(yi)部(bu)技(ji)術(shu)創(chuang)新史,更體現了(le)科學理(li)念(nian)的進化:從追求(qiu)結果(guo)到敬(jing)畏生(sheng)命,從征服自然到和諧共生(sheng)。
那些在(zai)紫外燈(deng)下或藍光儀中閃爍(shuo)的(de)熒光條帶,不僅是DNA的(de)蹤(zong)跡,更是人(ren)類科(ke)學理性(xing)與人(ren)文關懷(huai)交相(xiang)輝映的(de)光芒。每(mei)一次(ci)凝膠中亮起的(de)藍色熒光,都在(zai)默默講述著那些讓(rang)科(ke)學更安(an)全(quan)、更精(jing)準的(de)智慧故事。
